2006年，东南大学60个本科专业在全国共招生4000人，与往年持平。该校10个国家级重点学科包括:电磁场与微波技术、通信与信息系统、信号与信息处理等。

　　该校录取到电类、机械动力类等专业的优秀考生，可在收到“东南大学吴健雄学院申请表”后提出申请，经考核择优转入吴健雄学院学习。两年后学习优秀的吴健雄学院学生可重新选择能发挥自己特长的专业。

　　此外，记者还获悉，学生进入东南大学学习一年后，如果对所学专业不感兴趣，还可以调整专业。在符合一定条件的前提下，学生只要参加并通过学校组织的转系转专业考试，即可转入个人感兴趣的新专业学习。