处理好校长全面负责同党组织保证监督的关系，是校长负责制实施后面临的诸多关系中最重要最关键的一种关系。党组织的保证监督是新领导体制下党的领导的具体体现，是校长负责制的有机组成部分，也是校长负责制顺利实施的重要保证。校长要主动接受保证监督，建立同党组织联系、汇报、沟通的渠道，坚持党组织对思想政治工作的领导权，对决策的参与权，对学校干部的考查权，对校长工作的批评建议权，发挥和运用党组织对行政工作保证监督的巨大威力。

1．校长要正确处理同教代会的关系

教职工代表大会制度是我国在多年的实践中探索出来的有效的民主管理制度之一。校长全面负责同教职工民主管理的关系是衡量一所学校管理科学化、民主化的重要标志。校长要有自觉的民主管理意识，保证教代会工作的正常运行，保证教代会正常行使建议权、决定权、评议监督权。正确处理校长与教代会之间的关系，保证教职工的主人翁地位和合法权益，能有效调动校长与教职工两方面的积极性，促进校长全面负责和教职工民主管理关系的和谐发展。

2．校长要正确处理同各职能部门的关系

校长全面负责必须同各职能部门各司其职结合起来，只有这样，才能组成一个强有力的行政指挥系统。校长集权是同校长所负的职责联系在一起的。校长集权在先，各部门行使职权于后，有利于树立校长的权威，在校内外确立校长的法人地位，在教职工中强化校长是学校工作决策者的意识，增强学校凝聚力；也有利于校长运用赋予的权力，按教育规律办事，办出学校特色；还利校长迅速解决疑难问题，提高办事效率。校长集权要与科学分权相结合，校长集权在先，并不是把所有权力都始终掌握在自己手中，也不是事无巨细，件件点头，而是在集权的前提下依据科学管理原则，分权给各职能部门。各部门分权时必须做到责、权、利相结合，必须与建立各项规章制度相结合。同时，要不断强化目标意识和责任意识，造就上下级之间、各中层职能部门之间和谐的工作气氛。强化目标意识，要求各管理人员熟知学校工作的总目标，并能自觉地做好本职工作，为整体工作目标服务，还要求管理层人员有强烈的责任意识，有工作成就感，因此，学校应建立各管理层人员工作评价及奖惩制度，鼓励他们把全部精力贡献给学校的改革与发展事业。